Dans le cadre d'une manométrie œsophagienne, un petit tube (cathéter) est enfoncé dans la gorge jusque dans l'œsophage (il doit être avalé). Cet examen consiste à évaluer non pas la structure de l'œsophage, mais bien son fonctionnement. Il est généralement prescrit en cas de troubles liés au blocage d'aliments dans l'œsophage, qu'une gastroscopie n'aura pas permis d'éclairer. Il peut aussi servir à la préparation d'interventions chirurgicales au niveau de l'estomac et de l'œsophage. Totalement indolore, cet examen dure environ 10 minutes.
Dans le cas d'une manométrie anale, un petit tube (cathéter) est enfoncé dans l'anus jusqu'à la partie basse du côlon (le rectum). Cet examen permet d'étudier la fonction du sphincter. Il se justifie en cas d'incontinence fécale ou de troubles de la défécation. Totalement indolore, cet examen dure environ 10 minutes.